[mephi-hpc] Gamess на tensor

Tue Jan 27 18:52:00 MSK 2026

Большое вам спасибо! Буду пробовать!

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63

Вт, 27 янв. 2026 г. в 18:34, <anikeev at ut.mephi.ru>:

> anikeev at ut.mephi.ru писал 2026-01-26 17:47:
> > Павел Кулямин писал 2026-01-26 13:48:
> >> Имелась ввиду -  GAMESS (US).
> >
> > К сожалению, запуск GAMESS-US - это нетривиальный и плохо
> > документированный процесс. Для корректной работы приложения требуется
> > большое число правильно настроенных переменных окружения. В
> > дистрибутиве GAMESS-US прилагается пример скрипта запуска rungms,
> > который предлагается переписать под свою установку. Обратите внимание,
> > что в скрипте заявлен shebang /bin/csh, но сам скрипт написан на
> > диалекте tcsh. На мой взгляд, shebang следует заменить на /bin/tcsh.
> >
> > Для начала стоит изменить переменные TARGET, SCR, USERSCR, GMSPATH.
> > Затем, придется переписывать сам скрипт, поскольку он рассчитан на
> > работу со старым менеджером ресурсов PBS и со старой версией MPICH.
> >
> > Пакет slurm-wlm-torque для совместимости SLURM и PBS установлен на
> > всех кластерах Центра.
> >
> > Напишите, если Вам нужна помощь по исправлению этого скрипта.
>
> Пример сборки и запуска последовательной версии GAMESS-US:
>
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ wget
> https://github.com/OpenMathLib/OpenBLAS/archive/refs/tags/v0.3.31.tar.gz
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ tar -xvzf
> v0.3.31.tar.gz
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ cd OpenBLAS-0.3.31/
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$
> make DYNAMIC_ARCH=1 INTERFACE64=1
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$
> make PREFIX=/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/openblas install
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$ cd
> ../
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ tar -xvzf
> gamess-current.tar.gz
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ cd gamess/
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ ./config
> After the new window is open, please hit <ENTER> to go on. ENTER
> please enter your target machine name: linux64
> GAMESS directory? [/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess] ENTER
> GAMESS build directory? [/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess]
> ENTER
> Version? [00] ENTER
> HPC system target for 64-bit Linux system: ENTER
> Please enter your choice of FORTRAN: gfortran
> Please enter only the first decimal place, such as 8.2 or 11.2: 12.2
> Hit <ENTER> to continue to the math library setup. ENTER
> Enter your math library choice from one of the options below: openblas
> enter this full pathname:
> /mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/openblas/lib/
> communication library ('serial','sockets' or 'mpi' or 'mixed')? serial
> ...
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ make
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ cp rungms
> rungms_mine
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ mkdir -p
> /mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ diff
> rungms_mine rungms
> 1c1
> < #!/bin/tcsh -f
> ---
> > #!/bin/csh -f
> 98,101c98,101
> < set TARGET=serial
> < set SCR=/mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart
> < set USERSCR=/mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart
> < set GMSPATH=/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess
> ---
> > set TARGET=sockets
> > set SCR=~/gamess/restart
> > set USERSCR=~/gamess/restart
> > set GMSPATH=~/gamess
> anikeev at basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ cd
> tests/standard
> anikeev at unicluster://mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess/tests/standard$
>
> ../../rungms_mine exam01.inp 00
>
> Примеры стартовых скриптов для параллельной версии есть в файлах
> gamess/tools/gms и gamess/tools/ll-gms, но в них разработчиками
> захардкожены настройки для кластера разработчика.
>
> Сложность параллельного запуска GAMESS-US частично объясняется тем, что
> схема параллелизма была завершена к 1991 году, за 3 года до появления
> стандарта MPI. Основные алгоритмы были завершены в 1981-му, а начальный
> релиз датируется 1977-м.
>
> >> С уважением, Кулямин П.А.
> >>
> >> Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ
> >>
> >> Кафедра № 67 "Физика конденсированных
> >> сред"
> >>
> >> Научный руководитель: Маслов М.М.
> >>
> >> Тел:8-905-582-00-63
> >>
> >> пн, 26 янв. 2026 г. в 12:57, <anikeev at ut.mephi.ru>:
> >>
> >>> anikeev at ut.mephi.ru писал 2026-01-26 12:17:
> >>>> Павел Кулямин писал 2026-01-26 10:53:
> >>>>> Добрый день!
> >>>>
> >>>> Здравствуйте!
> >>>>
> >>>>> Подскажите есть ли установленный
> >>> Gamess
> >>>>> на кластере? Если нет то можете
> >>>>> подсказать как мне следует его
> >>>>> установить? Я пробовал действовать
> >>> по
> >>>>> инструкции однако после успешной
> >>>>> сборки openblas + openmpi не удается
> >>>>> запустить. Не могу понять в чем
> >>> дело.
> >>>>> Openblas lp64 ставил отдельно.
> >>>>
> >>>> Подскажет, про какой из GAMESS идет
> >>> речь?
> >>> Прошу прощения, опечатка:
> >>> Подскажите...
> >>>
> >>>> GAMESS-UK?
> >>>> GAMESS-US?
> >>>> GAMESS-PC?
> >>>>
> >>>>> С уважением, Кулямин П.А.
> >>>>>
> >>>>> Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ
> >>>>>
> >>>>> Кафедра № 67 "Физика
> >>> конденсированных
> >>>>> сред"
> >>>>>
> >>>>> Научный руководитель: Маслов М.М.
> >>>>>
> >>>>> Тел:8-905-582-00-63
> >>>>> _______________________________________________
> >>>>> hpc mailing list
> >>>>> hpc at lists.mephi.ru
> >>>>> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
> >>>>
> >>>> --
> >>>> С уважением,
> >>>> ведущий инженер отдела
> >>> UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,
> >>>> к.ф.-м.н.,
> >>>> Аникеев Артем.
> >>>> e-mail: anikeev at ut.mephi.ru
> >>>> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998
> >>>
> >>> --
> >>> С уважением,
> >>> ведущий инженер отдела UNIX-технологий
> >>> НИЯУ МИФИ,
> >>> к.ф.-м.н.,
> >>> Аникеев Артем.
> >>> e-mail: anikeev at ut.mephi.ru
> >>> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998
> >
> > --
> > С уважением,
> > ведущий инженер отдела UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,
> > к.ф.-м.н.,
> > Аникеев Артем.
> > e-mail: anikeev at ut.mephi.ru
> > тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998
> >
> > _______________________________________________
> > hpc mailing list
> > hpc at lists.mephi.ru
> > https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>
> --
> С уважением,
> ведущий инженер отдела UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,
> к.ф.-м.н.,
> Аникеев Артем.
> e-mail: anikeev at ut.mephi.ru
> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998
>
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20260127/8e28590e/attachment-0001.htm>