<div dir="auto">Большое вам спасибо! Буду пробовать!<br clear="all"><br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="auto"><div dir="ltr" style="font-size:12.8px">С уважением, Кулямин П.А.<br></div><div dir="ltr" style="font-size:12.8px"><div dir="auto">Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ<br></div><div>Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"<br></div><div dir="auto">Научный руководитель: Маслов М.М.<br></div><div dir="auto">Тел:8-905-582-00-63</div></div></div></div></div></div></div><div><br></div><div><br><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Вт, 27 янв. 2026 г. в 18:34, <<a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru">anikeev@ut.mephi.ru</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204,204,204)"><a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a> писал 2026-01-26 17:47:<br>
> Павел Кулямин писал 2026-01-26 13:48:<br>
>> Имелась ввиду -  GAMESS (US).<br>
> <br>
> К сожалению, запуск GAMESS-US - это нетривиальный и плохо<br>
> документированный процесс. Для корректной работы приложения требуется<br>
> большое число правильно настроенных переменных окружения. В<br>
> дистрибутиве GAMESS-US прилагается пример скрипта запуска rungms,<br>
> который предлагается переписать под свою установку. Обратите внимание,<br>
> что в скрипте заявлен shebang /bin/csh, но сам скрипт написан на<br>
> диалекте tcsh. На мой взгляд, shebang следует заменить на /bin/tcsh.<br>
> <br>
> Для начала стоит изменить переменные TARGET, SCR, USERSCR, GMSPATH.<br>
> Затем, придется переписывать сам скрипт, поскольку он рассчитан на<br>
> работу со старым менеджером ресурсов PBS и со старой версией MPICH.<br>
> <br>
> Пакет slurm-wlm-torque для совместимости SLURM и PBS установлен на<br>
> всех кластерах Центра.<br>
> <br>
> Напишите, если Вам нужна помощь по исправлению этого скрипта.<br>
<br>
Пример сборки и запуска последовательной версии GAMESS-US:<br>
<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ wget <br>
<a href="https://github.com/OpenMathLib/OpenBLAS/archive/refs/tags/v0.3.31.tar.gz" rel="noreferrer" target="_blank">https://github.com/OpenMathLib/OpenBLAS/archive/refs/tags/v0.3.31.tar.gz</a><br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ tar -xvzf <br>
v0.3.31.tar.gz<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ cd OpenBLAS-0.3.31/<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$ <br>
make DYNAMIC_ARCH=1 INTERFACE64=1<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$ <br>
make PREFIX=/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/openblas install<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/OpenBLAS-0.3.31$ cd <br>
../<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ tar -xvzf <br>
gamess-current.tar.gz<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess$ cd gamess/<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ ./config<br>
After the new window is open, please hit <ENTER> to go on. ENTER<br>
please enter your target machine name: linux64<br>
GAMESS directory? [/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess] ENTER<br>
GAMESS build directory? [/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess] <br>
ENTER<br>
Version? [00] ENTER<br>
HPC system target for 64-bit Linux system: ENTER<br>
Please enter your choice of FORTRAN: gfortran<br>
Please enter only the first decimal place, such as 8.2 or 11.2: 12.2<br>
Hit <ENTER> to continue to the math library setup. ENTER<br>
Enter your math library choice from one of the options below: openblas<br>
enter this full pathname: <br>
/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/openblas/lib/<br>
communication library ('serial','sockets' or 'mpi' or 'mixed')? serial<br>
...<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ make<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ cp rungms <br>
rungms_mine<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ mkdir -p <br>
/mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ diff <br>
rungms_mine rungms<br>
1c1<br>
< #!/bin/tcsh -f<br>
---<br>
> #!/bin/csh -f<br>
98,101c98,101<br>
< set TARGET=serial<br>
< set SCR=/mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart<br>
< set USERSCR=/mnt/pool/6/anikeev/gamess/restart<br>
< set GMSPATH=/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess<br>
---<br>
> set TARGET=sockets<br>
> set SCR=~/gamess/restart<br>
> set USERSCR=~/gamess/restart<br>
> set GMSPATH=~/gamess<br>
anikeev@basov:/mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess$ cd <br>
tests/standard<br>
anikeev@unicluster://mnt/pool/4/anikeev/pakuliamin/gamess/gamess/tests/standard$ <br>
../../rungms_mine exam01.inp 00<br>
<br>
Примеры стартовых скриптов для параллельной версии есть в файлах <br>
gamess/tools/gms и gamess/tools/ll-gms, но в них разработчиками <br>
захардкожены настройки для кластера разработчика.<br>
<br>
Сложность параллельного запуска GAMESS-US частично объясняется тем, что <br>
схема параллелизма была завершена к 1991 году, за 3 года до появления <br>
стандарта MPI. Основные алгоритмы были завершены в 1981-му, а начальный <br>
релиз датируется 1977-м.<br>
<br>
>> С уважением, Кулямин П.А.<br>
>> <br>
>> Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ<br>
>> <br>
>> Кафедра № 67 "Физика конденсированных<br>
>> сред"<br>
>> <br>
>> Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
>> <br>
>> Тел:8-905-582-00-63<br>
>> <br>
>> пн, 26 янв. 2026 г. в 12:57, <<a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a>>:<br>
>> <br>
>>> <a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a> писал 2026-01-26 12:17:<br>
>>>> Павел Кулямин писал 2026-01-26 10:53:<br>
>>>>> Добрый день!<br>
>>>> <br>
>>>> Здравствуйте!<br>
>>>> <br>
>>>>> Подскажите есть ли установленный<br>
>>> Gamess<br>
>>>>> на кластере? Если нет то можете<br>
>>>>> подсказать как мне следует его<br>
>>>>> установить? Я пробовал действовать<br>
>>> по<br>
>>>>> инструкции однако после успешной<br>
>>>>> сборки openblas + openmpi не удается<br>
>>>>> запустить. Не могу понять в чем<br>
>>> дело.<br>
>>>>> Openblas lp64 ставил отдельно.<br>
>>>> <br>
>>>> Подскажет, про какой из GAMESS идет<br>
>>> речь?<br>
>>> Прошу прощения, опечатка:<br>
>>> Подскажите...<br>
>>> <br>
>>>> GAMESS-UK?<br>
>>>> GAMESS-US?<br>
>>>> GAMESS-PC?<br>
>>>> <br>
>>>>> С уважением, Кулямин П.А.<br>
>>>>> <br>
>>>>> Аспирант 4 курса НИЯУ МИФИ<br>
>>>>> <br>
>>>>> Кафедра № 67 "Физика<br>
>>> конденсированных<br>
>>>>> сред"<br>
>>>>> <br>
>>>>> Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
>>>>> <br>
>>>>> Тел:8-905-582-00-63<br>
>>>>> _______________________________________________<br>
>>>>> hpc mailing list<br>
>>>>> <a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
>>>>> <a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
>>>> <br>
>>>> --<br>
>>>> С уважением,<br>
>>>> ведущий инженер отдела<br>
>>> UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,<br>
>>>> к.ф.-м.н.,<br>
>>>> Аникеев Артем.<br>
>>>> e-mail: <a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a><br>
>>>> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
>>> <br>
>>> --<br>
>>> С уважением,<br>
>>> ведущий инженер отдела UNIX-технологий<br>
>>> НИЯУ МИФИ,<br>
>>> к.ф.-м.н.,<br>
>>> Аникеев Артем.<br>
>>> e-mail: <a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a><br>
>>> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
> <br>
> --<br>
> С уважением,<br>
> ведущий инженер отдела UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,<br>
> к.ф.-м.н.,<br>
> Аникеев Артем.<br>
> e-mail: <a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a><br>
> тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
> <br>
> _______________________________________________<br>
> hpc mailing list<br>
> <a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
> <a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
<br>
--<br>
С уважением,<br>
ведущий инженер отдела UNIX-технологий НИЯУ МИФИ,<br>
к.ф.-м.н.,<br>
Аникеев Артем.<br>
e-mail: <a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru" target="_blank">anikeev@ut.mephi.ru</a><br>
тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
<br>
</blockquote></div></div>