[mephi-hpc] Установка QE basis

[Воскобойников Роман Евгеньевич]

​Пути все прописали?
Проверьте, какие значения присвоены переменным $PATH, $LIBRARY_PATH, $LD_LIBRARY_PATH, $C_INCLUDE_PATH, $CPLUS_INCLUDE_PATH.
Если значения не заданы, или заданы, но в них отсутствует fftw-3.3.9, заведите руками с командной строки:

export PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/bin:/$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/lib:$LIBRARY_PATH
export C_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$C_INCLUDE_PATH
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH

Роман

​


________________________________
От: hpc <hpc-bounces at lists.mephi.ru> от имени Павел Кулямин <dryes20115 at gmail.com>
Отправлено: 10 мая 2023 г. 11:41
Кому: NRNU MEPhI HPC discussion list
Тема: Re: [mephi-hpc] Установка QE basis

К сожалению так тоже не сработало:

cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.9/double/lib ..

Ошибка:

CMake Error at /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165 (message):
  Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)
Call Stack (most recent call first):
  /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458 (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)
  cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)
  FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)

Еще попробовал вот так:

cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 ..

Результат аналогичный.Также между разными попытками я очищал папку build, подскажите у вас есть еще какие-нибудь мысли по этому поводу?

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63


ср, 10 мая 2023 г. в 11:21, Воскобойников Роман Евгеньевич <REVoskoboinikov at mephi.ru<mailto:REVoskoboinikov at mephi.ru>>:

О том и речь. Поменяйте -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.8/ на -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.9/​, и будет Вам счастье.


Роман



________________________________
От: hpc <hpc-bounces at lists.mephi.ru<mailto:hpc-bounces at lists.mephi.ru>> от имени Павел Кулямин <dryes20115 at gmail.com<mailto:dryes20115 at gmail.com>>
Отправлено: 10 мая 2023 г. 10:55
Кому: NRNU MEPhI HPC discussion list
Тема: Re: [mephi-hpc] Установка QE basis

Роман, добрый день!

Большое спасибо за совет! А какой в таком случае должен быть путь до библиотеки fftw? В папке /opt/ я вижу только fftw-3.3.9/.

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63


ср, 10 мая 2023 г. в 05:36, Воскобойников Роман Евгеньевич <REVoskoboinikov at mephi.ru<mailto:REVoskoboinikov at mephi.ru>>:
Павел, здравствуйте.

У Вас неправильный путь к библиотеке указан. Должно быть 3.3.9, а у Вас стоит 3.3.8.

Роман
________________________________________
От: hpc [hpc-bounces at lists.mephi.ru<mailto:hpc-bounces at lists.mephi.ru>] от имени Павел Кулямин [dryes20115 at gmail.com<mailto:dryes20115 at gmail.com>]
Отправлено: 10 мая 2023 г. 3:35
Кому: NRNU MEPhI HPC discussion list
Тема: [mephi-hpc] Установка QE basis

Добрый день!

Столкнулся с проблемой при попытке установке QuantumEspresso на кластере basis с использованием GPU.

Порядок моих действий следующий:

1) Установка последней версии QE с помощью git clone
2) cd qe
   mkdir build
   cd build
   source /opt/fftw-3.3.9/double/customvars.sh
   source /opt/nvidia/hpc_sdk/nvvars.sh
   source /opt/nvidia/hpc_sdk/nv_mpi_vars.sh
  cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.8/double/include ..

Последняя команда выдает следующую ошибку:

CMake Error at /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165 (message):
  Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)
Call Stack (most recent call first):
  /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458 (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)
  cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)
  FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)

Подскажите, в чем может быть проблема?

Полный вывод последней команды приведен во вложении.

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63
_______________________________________________
hpc mailing list
hpc at lists.mephi.ru<mailto:hpc at lists.mephi.ru>
https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
_______________________________________________
hpc mailing list
hpc at lists.mephi.ru<mailto:hpc at lists.mephi.ru>
https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20230510/81b24724/attachment-0001.htm>