<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<div>Пути все прописали?<br>
</div>
<div>Проверьте, какие значения присвоены переменным <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$PATH</span>, $LIBRARY_PATH</span>, <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$LD_LIBRARY_PATH, <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$C_INCLUDE_PATH</span>, <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$CPLUS_INCLUDE_PATH.</span></span><br>
</div>
<div><span style="font-size: 12pt;">Е</span><span style="font-size: 12pt;">сли значения не заданы, или заданы, но </span><span style="font-size: 12pt;">в них
</span><span style="font-size: 12pt;">отсутствует </span>fftw-3.3.9, заведите руками с командной строки:<span style="font-size: 12pt;"> </span><span style="font-size: 12pt;"> </span><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">export PATH=/opt/fftw-3.3.9</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">/double/bin:/</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$PATH</span></div>
<div><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);"></span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">export
LD_LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">/double/lib:</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">$LD_LIBRARY_PATH</span><br>
</div>
<div>export LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/lib:$LIBRARY_PATH<br>
</div>
<div>export C_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$C_INCLUDE_PATH</div>
<div>export CPLUS_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH<br>
</div>
<div><br>
Роман<br>
</div>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div style="color: rgb(33, 33, 33);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>От:</b> hpc <hpc-bounces@lists.mephi.ru> от имени Павел Кулямин <dryes20115@gmail.com><br>
<b>Отправлено:</b> 10 мая 2023 г. 11:41<br>
<b>Кому:</b> NRNU MEPhI HPC discussion list<br>
<b>Тема:</b> Re: [mephi-hpc] Установка QE basis</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>К сожалению так тоже не сработало:</div>
<div><br>
</div>
<div>cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.9/double/lib ..</div>
<div> </div>
<div>Ошибка: <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>CMake Error at /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165 (message):<br>
Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)<br>
Call Stack (most recent call first):<br>
/usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458 (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)<br>
cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)<br>
FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)</div>
<div><br>
</div>
<div>Еще попробовал вот так:</div>
<div><br>
</div>
<div>cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 ..</div>
<div><br>
</div>
<div>Результат аналогичный.Также между разными попытками я очищал папку build, подскажите у вас есть еще какие-нибудь мысли по этому поводу?<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div dir="ltr" class="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div dir="auto">
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">С уважением, Кулямин П.А.<br>
</div>
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">
<div dir="auto">Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ<br>
</div>
<div>Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"<br>
</div>
<div dir="auto">Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
</div>
<div dir="auto">Тел:8-905-582-00-63</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</div>
<br>
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">ср, 10 мая 2023 г. в 11:21, Воскобойников Роман Евгеньевич <<a href="mailto:REVoskoboinikov@mephi.ru">REVoskoboinikov@mephi.ru</a>>:<br>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex; border-left:1px solid rgb(204,204,204); padding-left:1ex">
<div class="msg-8708860211411784638">
<div dir="ltr" style="font-size:12pt; color:rgb(0,0,0); background-color:rgb(255,255,255); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>О том и речь. <span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">Поменяйте
<span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">
<span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">-</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">DFFTW_LIBR</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">ARY</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">=/opt/fftw-</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">3.3.8/</span></span> на <span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)"></span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)"><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">-</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">DFFTW_LIBR</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">ARY</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">=/opt/fftw-</span><span style="color:rgb(33,33,33); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:16px; background-color:rgb(255,255,255)">3.3.9/</span>,
и будет Вам счастье. </span></span></span><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Роман<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div style="color:rgb(33,33,33)">
<hr style="display:inline-block; width:98%">
<div id="m_3633904134571866871divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>От:</b> hpc <<a href="mailto:hpc-bounces@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc-bounces@lists.mephi.ru</a>> от имени Павел Кулямин
<<a href="mailto:dryes20115@gmail.com" target="_blank">dryes20115@gmail.com</a>><br>
<b>Отправлено:</b> 10 мая 2023 г. 10:55<br>
<b>Кому:</b> NRNU MEPhI HPC discussion list<br>
<b>Тема:</b> Re: [mephi-hpc] Установка QE basis</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>Роман, добрый день!</div>
<div><br>
</div>
<div>Большое спасибо за совет! А какой в таком случае должен быть путь до библиотеки fftw? В папке /opt/ я вижу только fftw-3.3.9/.
<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<div dir="auto">
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">С уважением, Кулямин П.А.<br>
</div>
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">
<div dir="auto">Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ<br>
</div>
<div>Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"<br>
</div>
<div dir="auto">Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
</div>
<div dir="auto">Тел:8-905-582-00-63</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</div>
<br>
<div class="gmail_quote">
<div dir="ltr" class="gmail_attr">ср, 10 мая 2023 г. в 05:36, Воскобойников Роман Евгеньевич <<a href="mailto:REVoskoboinikov@mephi.ru" target="_blank">REVoskoboinikov@mephi.ru</a>>:<br>
</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex; border-left:1px solid rgb(204,204,204); padding-left:1ex">
Павел, здравствуйте.<br>
<br>
У Вас неправильный путь к библиотеке указан. Должно быть 3.3.9, а у Вас стоит 3.3.8.
<br>
<br>
Роман<br>
________________________________________<br>
От: hpc [<a href="mailto:hpc-bounces@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc-bounces@lists.mephi.ru</a>] от имени Павел Кулямин [<a href="mailto:dryes20115@gmail.com" target="_blank">dryes20115@gmail.com</a>]<br>
Отправлено: 10 мая 2023 г. 3:35<br>
Кому: NRNU MEPhI HPC discussion list<br>
Тема: [mephi-hpc] Установка QE basis<br>
<br>
Добрый день!<br>
<br>
Столкнулся с проблемой при попытке установке QuantumEspresso на кластере basis с использованием GPU.<br>
<br>
Порядок моих действий следующий:<br>
<br>
1) Установка последней версии QE с помощью git clone<br>
2) cd qe<br>
mkdir build<br>
cd build<br>
source /opt/fftw-3.3.9/double/customvars.sh<br>
source /opt/nvidia/hpc_sdk/nvvars.sh<br>
source /opt/nvidia/hpc_sdk/nv_mpi_vars.sh<br>
cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.8/double/include ..<br>
<br>
Последняя команда выдает следующую ошибку:<br>
<br>
CMake Error at /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165 (message):<br>
Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)<br>
Call Stack (most recent call first):<br>
/usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458 (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)<br>
cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)<br>
FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)<br>
<br>
Подскажите, в чем может быть проблема?<br>
<br>
Полный вывод последней команды приведен во вложении.<br>
<br>
С уважением, Кулямин П.А.<br>
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ<br>
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"<br>
Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
Тел:8-905-582-00-63<br>
_______________________________________________<br>
hpc mailing list<br>
<a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
<a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
hpc mailing list<br>
<a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
<a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>