[mephi-hpc] Установка QE basis

[Павел Кулямин]

Большое спасибо! Установка произошла без ошибок!

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63


ср, 10 мая 2023 г. в 13:59, Воскобойников Роман Евгеньевич <
REVoskoboinikov at mephi.ru>:

> ​Пути все прописали?
> Проверьте, какие значения присвоены переменным $PATH, $LIBRARY_PATH,
> $LD_LIBRARY_PATH, $C_INCLUDE_PATH, $CPLUS_INCLUDE_PATH.
> Если значения не заданы, или заданы, но в них отсутствует fftw-3.3.9,
> заведите руками с командной строки:
>
> export PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/bin:/$PATH
> export LD_LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/lib:$LD_LIBRARY_PATH
> export LIBRARY_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/lib:$LIBRARY_PATH
> export C_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$C_INCLUDE_PATH
> export
> CPLUS_INCLUDE_PATH=/opt/fftw-3.3.9/double/include:$CPLUS_INCLUDE_PATH
>
> Роман
>
> ​
>
>
> ------------------------------
> *От:* hpc <hpc-bounces at lists.mephi.ru> от имени Павел Кулямин <
> dryes20115 at gmail.com>
> *Отправлено:* 10 мая 2023 г. 11:41
> *Кому:* NRNU MEPhI HPC discussion list
> *Тема:* Re: [mephi-hpc] Установка QE basis
>
> К сожалению так тоже не сработало:
>
> cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90
> -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80
> -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.9/double/lib ..
>
> Ошибка:
>
> CMake Error at
> /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165
> (message):
>   Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)
> Call Stack (most recent call first):
>   /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458
> (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)
>   cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)
>   FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)
>
> Еще попробовал вот так:
>
> cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90
> -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80
> -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 ..
>
> Результат аналогичный.Также между разными попытками я очищал папку build,
> подскажите у вас есть еще какие-нибудь мысли по этому поводу?
>
> С уважением, Кулямин П.А.
> Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
> Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
> Научный руководитель: Маслов М.М.
> Тел:8-905-582-00-63
>
>
> ср, 10 мая 2023 г. в 11:21, Воскобойников Роман Евгеньевич <
> REVoskoboinikov at mephi.ru>:
>
>> О том и речь. Поменяйте -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.8/ на -DFFTW_LIBRARY
>> =/opt/fftw-3.3.9/​, и будет Вам счастье.
>>
>>
>> Роман
>>
>>
>>
>> ------------------------------
>> *От:* hpc <hpc-bounces at lists.mephi.ru> от имени Павел Кулямин <
>> dryes20115 at gmail.com>
>> *Отправлено:* 10 мая 2023 г. 10:55
>> *Кому:* NRNU MEPhI HPC discussion list
>> *Тема:* Re: [mephi-hpc] Установка QE basis
>>
>> Роман, добрый день!
>>
>> Большое спасибо за совет! А какой в таком случае должен быть путь до
>> библиотеки fftw? В папке /opt/ я вижу только fftw-3.3.9/.
>>
>> С уважением, Кулямин П.А.
>> Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
>> Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
>> Научный руководитель: Маслов М.М.
>> Тел:8-905-582-00-63
>>
>>
>> ср, 10 мая 2023 г. в 05:36, Воскобойников Роман Евгеньевич <
>> REVoskoboinikov at mephi.ru>:
>>
>>> Павел, здравствуйте.
>>>
>>> У Вас неправильный путь к библиотеке указан. Должно быть 3.3.9, а у Вас
>>> стоит 3.3.8.
>>>
>>> Роман
>>> ________________________________________
>>> От: hpc [hpc-bounces at lists.mephi.ru] от
>>> имени Павел Кулямин [dryes20115 at gmail.com]
>>> Отправлено: 10 мая 2023 г. 3:35
>>> Кому: NRNU MEPhI HPC discussion list
>>> Тема: [mephi-hpc] Установка QE basis
>>>
>>> Добрый день!
>>>
>>> Столкнулся с проблемой при попытке установке QuantumEspresso на кластере
>>> basis с использованием GPU.
>>>
>>> Порядок моих действий следующий:
>>>
>>> 1) Установка последней версии QE с помощью git clone
>>> 2) cd qe
>>>    mkdir build
>>>    cd build
>>>    source /opt/fftw-3.3.9/double/customvars.sh
>>>    source /opt/nvidia/hpc_sdk/nvvars.sh
>>>    source /opt/nvidia/hpc_sdk/nv_mpi_vars.sh
>>>   cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90
>>> -DQE_ENABLE_CUDA=ON -QE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -NVFORTRAN_CUDA_CC=80
>>> -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -DFFTW_LIBRARY=/opt/fftw-3.3.8/double/include ..
>>>
>>> Последняя команда выдает следующую ошибку:
>>>
>>> CMake Error at
>>> /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:165
>>> (message):
>>>   Could NOT find FFTW3 (missing: FFTW3_LIBRARIES)
>>> Call Stack (most recent call first):
>>>   /usr/share/cmake-3.18/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:458
>>> (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)
>>>   cmake/FindFFTW3.cmake:463 (find_package_handle_standard_args)
>>>   FFTXlib/CMakeLists.txt:103 (find_package)
>>>
>>> Подскажите, в чем может быть проблема?
>>>
>>> Полный вывод последней команды приведен во вложении.
>>>
>>> С уважением, Кулямин П.А.
>>> Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
>>> Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
>>> Научный руководитель: Маслов М.М.
>>> Тел:8-905-582-00-63
>>> _______________________________________________
>>> hpc mailing list
>>> hpc at lists.mephi.ru
>>> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>>>
>> _______________________________________________
>> hpc mailing list
>> hpc at lists.mephi.ru
>> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>>
> _______________________________________________
> hpc mailing list
> hpc at lists.mephi.ru
> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20230510/fd5c1c6d/attachment-0001.htm>