[mephi-hpc] PGI compiler

[Жариков Евгений Сергеевич]

Добрый вечер!

HPC SDK успешно установился, также вроде бы успешно собрался Quantum Espresso (gpu-версия требует исключительно PGI).

Однако, при запуске (средствами mpi, входящими в состав HPC SDK) возникает ошибка (ниже). Очевидно есть какой-то нюанс или специальные ключи запуска в этом случае? Остальное ПО (к примеру, LAMMPS, собранный штатными gcc и mpi Tensor запускается и работает нормально).

Спасибо!

WARNING: There are more than one active ports on host 't1n1', but the
default subnet GID prefix was detected on more than one of these
ports.  If these ports are connected to different physical IB
networks, this configuration will fail in Open MPI.  This version of
Open MPI requires that every physically separate IB subnet that is
used between connected MPI processes must have different subnet ID
values.

Please see this FAQ entry for more details:

  http://www.open-mpi.org/faq/?category=openfabrics#ofa-default-subnet-gid

NOTE: You can turn off this warning by setting the MCA parameter
      btl_openib_warn_default_gid_prefix to 0.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
A process has executed an operation involving a call to the
"fork()" system call to create a child process.  Open MPI is currently
operating in a condition that could result in memory corruption or
other system errors; your job may hang, crash, or produce silent
data corruption.  The use of fork() (or system() or other calls that
create child processes) is strongly discouraged.

The process that invoked fork was:

  Local host:          [[29162,1],4] (PID 11211)

If you are *absolutely sure* that your application will successfully
and correctly survive a call to fork(), you may disable this warning
by setting the mpi_warn_on_fork MCA parameter to 0.

25 янв. 2021 г., в 16:25, Жариков Евгений Сергеевич <ESZharikov at mephi.ru<mailto:ESZharikov at mephi.ru>> написал(а):

Большое спасибо за информацию!

25 янв. 2021 г., в 16:23, anikeev <anikeev at ut.mephi.ru<mailto:anikeev at ut.mephi.ru>> написал(а):

On Mon, 2021-01-25 at 12:31 +0000, Жариков Евгений Сергеевич wrote:
Добрый день!

Здравствуйте!

Есть ли какая-нибудь возможность установить в будущем на кластер
Tensor компилятор PGI?

https://developer.nvidia.com/openacc-toolkit

Полноценная версия PGI платная. Если какое-то подразделение готово
спонсировать закупку ПО, это можно сделать. Есть бесплатная версия
Community Edition с ограниченной поддержкой.

На Tensor установлена версия Nvidia SDK, поддерживаемая дистрибутивом
ОС. PGI NVFortran Community Edition вошел в состав Nvidia HPC SDK
сравнительно недавно, и его пока нет в дистрибутиве. Обновление
дистрибутива планируется при релизе Debian 11, т.е. примерно в июне-
июле 2021.

Для установки HPC SDK не нужны права администратора, Вы можете это
сделать сами. Насколько я помню, ПО фирмы PGI обычно довольно
проблемное. Если Вам потребуется контейнерное окружение, отличное от
Debian, Вы можете использовать proot:

https://proot-me.github.io/

Попробуйте пока поставить для своего пользователя сами. Если возникнут
проблемы - обращайтесь.

Спасибо!


С уважением,
Евгений Жариков
_______________________________________________
hpc mailing list
hpc at lists.mephi.ru
https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
--
С уважением,
инженер отдела Unix-технологий МИФИ,
Аникеев Артём.
Тел.: 8
(495) 788-56-99, доб. 8998
_______________________________________________
hpc mailing list
hpc at lists.mephi.ru
https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc


-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20210203/f36569af/attachment.html>