[mephi-hpc] hdf5

[Phil Korneev]

Добрый день,
на Черенкове я пытаюсь скомпилировать программу Smilei (
http://www.maisondelasimulation.fr/smilei/releases.html#current-release-4-1),
использующую hdf5. Обычно makefile сам определяет где что лежит, но в этом
случае не нашёл:

In file included from src/Checkpoint/Checkpoint.cpp:7:0:
src/Checkpoint/Checkpoint.h:13:18: fatal error: hdf5.h: No such file or
directory
compilation terminated.
makefile:176: recipe for target 'build/src/Checkpoint/Checkpoint.o' failed
make: *** [build/src/Checkpoint/Checkpoint.o] Error 1


 Когда я попытался прописать путь руками /usr/include/hdf5/serial,
появилась другая ошибка, связанная тоже с hdf5:

 src/Collisions/Collisions.cpp:383:56: error: ‘H5Pset_dxpl_mpio’ was not
declared in this scope
         H5Pset_dxpl_mpio(transfer, H5FD_MPIO_COLLECTIVE);
                                                        ^
makefile:176: recipe for target 'build/src/Collisions/Collisions.o' failed
make: *** [build/src/Collisions/Collisions.o] Error 1

Подскажите, если возможно, что не так с hdf5 на Черенкове или я что-то не
понимаю?
Спасибо!
с уважением,
фк
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20190212/f27389e1/attachment.html>