[mephi-hpc] Ошибка записи в /pool

[Dmitry Zhuk]

Странно, у меня никаких ошибок с неправильным адресом файла нет.
Я вот так запускаю:
ssh cherenkov
cd ~/pool/1/zr_roll16_1_33
source /mnt/pool/1/dimazhuk/DAMASK/DAMASK_env.sh
/mnt/pool/1/dimazhuk/DAMASK/bin/DAMASK_spectral --geom fourh.geom --load
rolling3x.load

Ошибка все та же, без изменений.

2017-10-31 16:59 GMT+03:00 anikeev <anikeev at ut.mephi.ru>:

> On Tue, 2017-10-31 at 16:24 +0300, Dmitry Zhuk wrote:
> > Запись шла в /pool/1/zr_roll16_1_33
> > Запустить программу c cherenkov можно из этой же папки так:
> >
> > source /mnt/pool/1/dimazhuk/DAMASK/DAMASK_env.sh
> > /mnt/pool/1/dimazhuk/DAMASK/bin/DAMASK_spectral --geom fourh.geom --
> > load rolling3x.load
>
> Я обнаружил на /mnt/pool/1 некорректно обработанную блокировку файла.
> Обычно такое происходит при некорректном завершении работы приложения,
> либо при наличии ошибки в логике работы с блокировками фалов.
>
> Я сбросил блокировки rpcbind вручную, сейчас всё должно работать.
> Проверить не могу - в Вашем примере где-то сломаны пути:
>
> dimazhuk at master.cherenkov ~ $
> /mnt/pool/1/dimazhuk/DAMASK/bin/DAMASK_spectral --geom fourh.geom --
> load rolling3x.load
> ...
>  + could not open file:                                   +
>  + /home/dimazhuk/fourh.geom                              +
> ...
> dimazhuk at master.cherenkov ~ $ ls -lah /home/dimazhuk/fourh.geom
> ls: cannot access /home/dimazhuk/fourh.geom: No such file or directory
>
> Что касается самого сообщения об ошибке, на /mnt/pool/1 используется
> как раз NFSv3. Опцию 'noac' использовать невозможно, поскольку она
> приведёт к значительному падению производительности.
>
> Напишите, пожалуйста, в случае повторения ошибки. Снять блокировку
> вручную может только системный администратор.
>
> > 2017-10-31 16:04 GMT+03:00 anikeev <anikeev at ut.mephi.ru>:
> > > On Tue, 2017-10-31 at 15:36 +0300, Dmitry Zhuk wrote:
> > > > Добрый день!
> > >
> > > Здравствуйте!
> > >
> > > > Перестала работать программа при записи в pool.
> > >
> > > Подскажите, на какой из /pool/{1..4} шла запись и откуда
> > > запускалась
> > > программа? Что это за программа? Как запустить аналогичную задачу,
> > > не
> > > повредив Ваши данные?
> > >
> > > > При попытке записи выдает
> > > >
> > > > File locking failed in ADIOI_Set_lock(fd 19,cmd F_SETLKW/7,type
> > > > F_WRLCK/1,whence 0) with return value FFFFFFFF and errno 5.
> > > > - If the file system is NFS, you need to use NFS version 3,
> > > ensure
> > > > that the lockd daemon is running on all the machines, and mount
> > > the
> > > > directory with the 'noac' option (no attribute caching).
> > > > - If the file system is LUSTRE, ensure that the directory is
> > > mounted
> > > > with the 'flock' option.
> > > > ADIOI_Set_lock:: Input/output error
> > > > ADIOI_Set_lock:offset 0, length 8
> > > >
> > > > В /home все записывается нормально.
> > > > _______________________________________________
> > > > hpc mailing list
> > > > hpc at lists.mephi.ru
> > > > https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
> > > --
> > > С уважением,
> > > инженер отдела Unix-технологий МИФИ,
> > > Аникеев Артём.
> > > Тел.: 8
> > > (495) 788-56-99, доб. 8998
> > > _______________________________________________
> > > hpc mailing list
> > > hpc at lists.mephi.ru
> > > https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
> > >
> >
> > _______________________________________________
> > hpc mailing list
> > hpc at lists.mephi.ru
> > https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
> --
> С уважением,
> инженер отдела Unix-технологий МИФИ,
> Аникеев Артём.
> Тел.: 8
> (495) 788-56-99, доб. 8998
> _______________________________________________
> hpc mailing list
> hpc at lists.mephi.ru
> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20171031/4d88b4cc/attachment-0001.html>