[mephi-hpc] Quantum espresso parallel

Васильев Олег Станиславович OSVasilyev at mephi.ru
Wed Aug 31 16:32:55 MSK 2016


Здравствуйте!
Проблемы с параллельным запуском задач Quantum Espresso, в частности программы pw.x . Установил пакет на osvasilyev at master.unicluster. Тестовые задачи на одном процессоре идут, но параллельно еще ни разу не отработало без ошибки, обычно это "segmentation fault".  В FAQ Espresso пишут, что дело может быть в
  -  too much RAM memory or stack requested (see next item).
  -  if you are using highly optimized mathematical libraries, verify that they are designed for your hardware.
  -  If you are using aggressive optimization in compilation, verify that you are using the appropriate options for your machine
  -  The executable was not properly compiled, or was compiled on a different and incompatible environment.
  -  buggy compiler or libraries: this is the default explanation if you have problems with the provided tests and examples.

 памяти я вряд ли много запрашиваю, а вот с библиотеками еще при конфигурировании возникали сложности, как с поиском и определением установленных, так и с использованием внутренних (QE).

Вот пример неработающей задачи: 

#!/bin/sh
#
#PBS -l nodes=4:ppn=8,walltime=48:00:00

. ~/espresso-5.4.0/13

mpirun pw.x -np 8 <test.in >test.out

walltime, очередь, число узлов и ядер пробовал разные. Проблем в инпуте нет, т.к. на локальной машине (не параллельно) это работает. 

Помогите пожалуйста разобраться, в чем причина  и что я делаю не так.



С Уважением, 
Олег С. Васильев
каф. №78 НИЯУ МИФИ


More information about the hpc mailing list