[mephi-hpc] Установка QE basis

[Павел Кулямин]

Большое спасибо за разъяснения! Пересобрал согласно вашим рекомендациям.

Хочу еще спросить про компиляцию qe на кластере tensor для работы с
очередями avx512.

На кластере tensor я скомпилировал qe следующим образом:

git clone https://gitlab.com/QEF/q-e.git
cd q-e/
git checkout qe-7.2

mkdir build
cd build/
source /opt/fftw-3.3.9/double/customvars.sh
source /opt/openblas-0.3.17/customvars.sh

cmake -DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/mnt/pool/3/pakuliamin/qe_tensor_cpu/q-e
-DBLA_VENDOR=OpenBLAS -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 ../

make -j 16
make install

Такой вариант скомпилированного qe подходит для использования в avx512
очередях на кластере tensor?

С уважением, Кулямин П.А.
Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ
Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"
Научный руководитель: Маслов М.М.
Тел:8-905-582-00-63


ср, 10 мая 2023 г. в 18:00, anikeev <anikeev at ut.mephi.ru>:

> On Wed, 2023-05-10 at 11:41 +0300, Павел Кулямин wrote:
> > К сожалению так тоже не сработало:
>
> Здравствуйте!
>
> Для начала, я настоятельно не рекомендую использовать ночные сборки в
> научных работах. Последний официальный релиз QE это 7.2:
>
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe$ git clone
> https://gitlab.com/QEF/q-e.git
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe$ cd q-e/
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e$ git checkout qe-7.2
>
> При работе с cmake рабочую директорию (build) нужно удалять полностью
> после каждой сборки. Аналога make clean для cmake нет.
>
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e$ mkdir build
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e$ cd build/
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e/build$ source
> /opt/nvidia/hpc_sdk/nvvars.sh
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e/build$ source
> /opt/nvidia/hpc_sdk/nv_mpi_vars.sh
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e/build$ which mpif90
> /opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/21.3/comm_libs/mpi/bin/mpif90
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e/build$ which mpicc
> /opt/nvidia/hpc_sdk/Linux_x86_64/21.3/comm_libs/mpi/bin/mpicc
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe$ source /opt/fftw-
> 3.3.9/double/customvars.sh
>
> FFTW ROOT - это директория, которая содержит субдиректории ./lib и
> ./include.
>
> anikeev at basis:/mnt/pool/6/anikeev/qe/q-e/build$ cmake -
> DCMAKE_C_COMPILER=mpicc -DCMAKE_Fortran_COMPILER=mpif90 -
> DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/mnt/pool/6/anikeev/qe -DQE_ENABLE_CUDA=ON -
> DQE_ENABLE_MPI_GPU_AWARE=ON -DNVFORTRAN_CUDA_CC=80 -
> DNVFORTRAN_CUDA_VERSION=11.2 -DQE_FFTW_VENDOR=FFTW3 -
> DFFTW3_ROOT=/opt/fftw-3.3.9/double/ ../
>
> Если Вы выберете версию FFTW с поддержкой OMP, не забывайте управлять
> переменной окружения OMP_NUM_THREADS (export OMP_NUM_THREADS=1) при
> запуске задач.
>
> --
> С уважением,
> ведущий инженер отдела Unix-технологий МИФИ,
> к.ф.-м.н., Аникеев Артём.
> Тел.: +7 (495) 788-56-99, доб. 8998
> e-mail: aaanikeyev at mephi.ru, anikeev at ut.mephi.ru
>
> Best regards,
> MEPhI UNIX-technology department lead engineer,
> Artem Anikeev, Ph.D.
> Phone: +7 (495) 788-56-99, ext. 8998
> e-mail: aaanikeyev at mephi.ru, anikeev at ut.mephi.ru
> _______________________________________________
> hpc mailing list
> hpc at lists.mephi.ru
> https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc
>
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.mephi.ru/pipermail/hpc/attachments/20230510/b6dec130/attachment.htm>