[mephi-hpc] Технические работы на кластере

[Alexandra Freidzon]

Добрый день!

Когда оживет ~/pool ? очень работать хочется...

4 октября 2013 г., 21:35 пользователь Andrew A. Savchenko
<bircoph at ut.mephi.ru> написал:
> Уважаемые пользователи,
>
> Доступ к кластеру был восстановлен ко всей функциональности, кроме
> распределённой файловой системы на ~/pool (/mnt/cluster/...). Работы
> с OrangeFS продолжаются, о их окончании будет объявлено позже.
>
> На кластере было проведено серьёзное обновление используемых
> библиотек, поэтому возможны проблемы с запуском приложений, собранных
> со старыми версиями *.so. Для их решения следует перекомпилировать
> проблемные приложения.
>
> Так же были установлены дополнительные библиотеки и приложения,
> с учётом потребностей и задач нынешних пользователей.
>
> Доступны библиотеки, предоставляющие следующие интерфейсы
> (звёздочкой отмечены используемые по умолчанию):
> BLAS:
> atlas
> atlas-threads
> eigen
> gotoblas-openmp
> openblas-openmp *
> reference
>
> LAPACK:
> atlas *
> atlas-threads
> reference
>
> BLACS:
> mpiblas *
>
> CBLAS:
> atlas
> atlas-threads
> eigen
> gotoblas-openmp
> openblas-openmp *
> reference
>
> LAPACKE:
> reference *
>
> По тесту Linpack (HPL) лучшим вариантом BLAS является
> openblas-openmp, а LAPACK -- atlas, которые и задействованы сейчас по
> умолчанию. Для использования остальных библиотек необходимо указывать
> пути к ним при линковки или использовать LD_PRELOAD.
>
> Так же были установлены следующие приложения:
> gamess-20130501.1
> geant-4.9.6_p02
> geant-vmc-3.1.15a
> gnuplot-4.6.3
> lammps-20130923
> maxima-5.30.0
> octave-3.6.4
> openfoam-2.2.1
> pythia-6.4.27
> pythia-8.1.76
> root-5.34.09
> scipy-0.12.0
>
> По данным Linpack (HPL) производительность одного узла кластера
> составляет 58.12 GFlops = 60.69% пиковой, а всех 13 узлов:
> 705.2 GFlops = 56.64% пиковой. Оптимальной является конфигурация
> (P,Q): P=1, Q=N, где N число ядер, поэтому пользовательским
> приложениям рекомендуется учитывать издержки и высокие задержки
> (latency) при интерконнекте.
>
> Best regards,
> Andrew Savchenko
>
> _______________________________________________
> hpc mailing list
> hpc at lists.ut.mephi.ru
> http://lists.ut.mephi.ru/listinfo/hpc
>