<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=koi8-r">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Павел, здравствуйте.</p>
<p><br>
</p>
<p>Long story short, <span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">поврежден</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">а</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);"> </span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">файловая </span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">с</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">истема
на вычислительном ноде кластера </span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">ба</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">зис</span><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">. </span></p>
<p><span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);"></span><br>
</p>
<div>Проблема возникла рано утром в пятницу 30 июня. Письмо А.А.Аникееву послано в пятницу и повторно сегодня. Ответа пока нет.<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Cheers,<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Роман<br>
</div>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<div style="color: rgb(33, 33, 33);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>От:</b> hpc <hpc-bounces@lists.mephi.ru> от имени Павел Кулямин <dryes20115@gmail.com><br>
<b>Отправлено:</b> 3 июля 2023 г. 17:00<br>
<b>Кому:</b> NRNU MEPhI HPC discussion list<br>
<b>Тема:</b> [mephi-hpc] Ошибка при попытке запуска задачи на кластере basis</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>Добрый день!</div>
<div><br>
</div>
<div>Столкнулся с следующей проблемой, при запуске расчета с помощью программы Quantum Espresso на кластере Basis получаю ошибку следующего характера:</div>
<div><br>
</div>
<div>--------------------------------------------------------------------------<br>
A call to mkdir was unable to create the desired directory:<br>
<br>
Directory: /tmp<br>
Error: File exists<br>
<br>
Please check to ensure you have adequate permissions to perform<br>
the desired operation.<br>
--------------------------------------------------------------------------<br>
[t2n1:170080] [[51516,0],0] ORTE_ERROR_LOG: Error in file ../../orte/util/session_dir.c at line 106<br>
[t2n1:170080] [[51516,0],0] ORTE_ERROR_LOG: Error in file ../../orte/util/session_dir.c at line 345<br>
--------------------------------------------------------------------------<br>
It looks like orte_init failed for some reason; your parallel process is<br>
likely to abort. There are many reasons that a parallel process can<br>
fail during orte_init; some of which are due to configuration or<br>
environment problems. This failure appears to be an internal failure;<br>
here's some additional information (which may only be relevant to an<br>
Open MPI developer):<br>
<br>
orte_session_dir failed<br>
--> Returned value Error (-1) instead of ORTE_SUCCESS<br>
--------------------------------------------------------------------------</div>
<div><br>
</div>
<div>Для запуска расчета используется следующий скрипт:</div>
<div><br>
</div>
<div>#!/bin/bash<br>
#SBATCH --partition=gpu<br>
#SBATCH --nodes=1<br>
#SBATCH --gres=gpu:1<br>
#SBATCH --ntasks=1<br>
#SBATCH --time=300:00:00<br>
cd /mnt/pool/3/pakuliamin/QuantumEspresso/WS2/PS_59<br>
source /opt/nvidia/hpc_sdk/nvvars.sh<br>
source /opt/nvidia/hpc_sdk/nv_mpi_vars.sh<br>
source /opt/fftw-3.3.9/double/customvars.sh<br>
mpirun --mca btl self,smcuda /mnt/pool/3/pakuliamin/qe_basis/q-e/bin/pw.x -input relax.inp | tee relax.out<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Ранее задачи запускались успешно.<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div> С чем может быть связана такая ошибка и как стоит ее исправить?<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div dir="ltr" class="gmail_signature">
<div dir="ltr">
<div dir="auto">
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">С уважением, Кулямин П.А.<br>
</div>
<div dir="ltr" style="font-size:12.8px">
<div dir="auto">Аспирант 2 курса НИЯУ МИФИ<br>
</div>
<div>Кафедра № 67 "Физика конденсированных сред"<br>
</div>
<div dir="auto">Научный руководитель: Маслов М.М.<br>
</div>
<div dir="auto">Тел:8-905-582-00-63</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>