<div dir="ltr">Добрый день,<br><br>Для запуска задачи сначала необходимо скомпилировать код - я это делал следующим образом - создавал в папке 'pond_force' директорию build, переходил в нее и использовал команду cmake для создания makefile, а затем компилировал при помощи make - после этого в исходной директории 'pond_force' появляется исполняемый файл 'elektra'.<br><br>Затем, когда код скомпилирован, необходимо создать в директории 'pond_force' папку 'results' - в нее будут записываться создаваемые кодом файлы. Далее можно производить запуск с помощью .sh скрипта, который обращается к исполняемому файлу 'elektra'. Свой .sh скрипт я приложил к предыдущему письму ('run.sh'). При этом для расчета используются параметры файлов из папки 'config' - их можно не менять, но папка 'config' должна также быть в директории 'pond_force'. <br>Спустя какое-то время в .out файле должны начать появляться данные о прогрессе от каждого из процессов, а в папке results - .h5 файлы с результатами расчета. Ранее при запуске на 64 ядрах каждые 10 минут появлялось где-то штук 30 новых файлов. Сейчас же ничего не происходит и за 30 минут, а в .out файле не появляется вообще никаких выводов.<br><br>---<br>С уважением,<br>Бухарский Николай</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">пт, 10 сент. 2021 г. в 11:50, anikeev <<a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru">anikeev@ut.mephi.ru</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">On Fri, 2021-09-10 at 02:11 +0300, Николай Бухарский wrote:<br>
> Добрый день!<br>
<br>
Здравствуйте!<br>
<br>
> После обновления кластера cherenkov перестала считаться одна из<br>
> задач, которая ранее работала без нареканий. Код и файл, с помощью<br>
> которого ее запускаю, прикладываю. <br>
> <br>
> Для компиляции использовал cmake, его файл также прикладываю. На<br>
> этапе компиляции никаких ошибок не возникает. Однако скомпилированный<br>
> код при запуске не производит никаких данных, но и не закрывается из-<br>
> за каких-либо ошибок, то есть просто висит мертвым грузом. Заметил<br>
> только, что при запуске задачи на 218 ноде в логе выводится: <br>
> slurmstepd: error: file_write uint32: unable to open '(null)/tasks'<br>
> for writing: No such file or directory <br>
> slurmstepd-n: error: unable to add task[pid=5606] to memory cg<br>
> '(null)'<br>
> С другими нодами же не выводится вообще ничего.<br>
> <br>
> Подскажите пожалуйста, с чем это может быть связано и как это можно<br>
> исправить?<br>
<br>
Подскажите, пожалуйста, как можно полностью воспроизвести запуск Вашей<br>
задачи на самом кластере, используя оригинальные директории и<br>
исполняемые файлы?<br>
<br>
> ---<br>
> С уважением,<br>
> Бухарский Николай<br>
> _______________________________________________<br>
> hpc mailing list<br>
> <a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
> <a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
<br>
-- <br>
С уважением,<br>
инженер отдела Unix-технологий МИФИ,<br>
Аникеев Артём.<br>
Тел.: 8 (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
<br>
_______________________________________________<br>
hpc mailing list<br>
<a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru" target="_blank">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
<a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
</blockquote></div>