<HTML><BODY>Спасибо!<br>Входные файлы и скрипт для запуска задачи поместила в pool/4/mishutikova/W_444_test<br>Наверное, лучше дождаться завершения моей текущей задачи, и запускать после, тогда наверняка ничего не повредится.<br>И я после нее не буду пока ставить задач, дождусь Вашего совета.<br><br><blockquote style="border-left:1px solid #0857A6; margin:10px; padding:0 0 0 10px;">
Пятница, 8 февраля 2019, 16:04 +03:00 от anikeev <anikeev@ut.mephi.ru>:<br>
<br>
<div id="">
<div class="js-helper js-readmsg-msg">
<style type="text/css"></style>
<div>
<base target="_self" href="https://e.mail.ru/">
<div id="style_15496310430000000417_BODY">On Fri, 2019-02-08 at 15:55 +0300, Мария Шутикова wrote:<br>
> Понятно!<br>
> Значит из того, что задачи с nodes=1::ppn=32 и OMP_NUM_THREADS=1, 4,<br>
> 8, 32 так завершаются, а задача с nodes=1::ppn=1<br>
> и OMP_NUM_THREADS=1 считается 10 часов, осталось поменять pnn,<br>
> скажем, на nodes=1::ppn=4, чтобы задача не завершалась как<br>
> зависшая, и подобрать OMP_NUM_THREADS, или я ошибаюсь?<br>
Как запустить Вашу задачу, не повредив Ваши данные? Что-то с ней<br>
слишком много проблем, давайте я посмотрю более детально.<br>
<br>
> Пятница, 8 февраля 2019, 14:15 +03:00 от anikeev <<a href="mailto:anikeev@ut.mephi.ru">anikeev@ut.mephi.ru</a><br>
> >:<br>
> <br>
> On Fri, 2019-02-08 at 10:20 +0300, Мария Шутикова wrote:<br>
> > Здравствуйте!<br>
> Добрый день!<br>
> <br>
> > Мой вопрос про ppn возник не с проста!<br>
> > В папке pool/4/mishutikova остались файлы torque от двух задач:<br>
> > W444job.sh.o143244, соответствующий запуску с nodes=1::ppn=1<br>
> > и OMP_NUM_THREADS=1<br>
> > <br>
> > и<br>
> > <br>
> > W444job.sh.o143517, соответствующий запуску с nodes=1::ppn=32<br>
> > и OMP_NUM_THREADS=1<br>
> > <br>
> > В первом случае задача посчиталась полностью (через ~10 часов) и<br>
> > написала в конце Job completed<br>
> > <br>
> > Во втором случае задача застыла через примерно 40 минут работы и<br>
> > все. Если зайти и проверить ее статус, то выясняется, что задачи<br>
> > больше нет, хотя она стояла в очереди long, и время выйти еще не<br>
> > должно было.<br>
> > И вот так было и раньше когда я ставила ppn=32<br>
> > <br>
> > Вот...<br>
> <br>
> Torque не различает задачи, завершившиеся аварийно или штатно. Он<br>
> просто записывает STDOUT и STDERR.<br>
> <br>
> Проблема оказалась в том, что Ваша задача потребляет слишком малую<br>
> часть запрошенных ресурсов и принудительно завершается как зависшая.<br>
> Попробуйте начать с OMP_NUM_THREADS=4 и больше.<br>
> <br>
> > _______________________________________________<br>
> > hpc mailing list<br>
> > <a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
> > <a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
> -- <br>
> С уважением,<br>
> инженер отдела Unix-технологий МИФИ,<br>
> Аникеев Артём.<br>
> Тел.: 8<br>
> (495) 788-56-99, доб. 8998<br>
> <br>
> <br>
> _______________________________________________<br>
> hpc mailing list<br>
> <a href="mailto:hpc@lists.mephi.ru">hpc@lists.mephi.ru</a><br>
> <a href="https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc" target="_blank">https://lists.mephi.ru/listinfo/hpc</a><br>
-- <br>
С уважением,<br>
инженер отдела Unix-технологий МИФИ,<br>
Аникеев Артём.<br>
Тел.: 8<br>
(495) 788-56-99, доб. 8998<br>
</div>
<base target="_self" href="https://e.mail.ru/">
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<br>
<br>-- <br>Мария Шутикова<br></BODY></HTML>